El clima en el área de estudio corresponde en general a los regímenes subtropicales y tropicales. Se presenta poca variación climática por las leves diferencias altitudinales que van desde menos de 2000 msnm en el Subandido a menos de 130 msnm en el extremo Norte de la Llanura Amazónica. La precipitación anual varía desde 1500 hasta 2000 mm; la temperatura media anual de 22 a 27ºC. Las zonas de mayor precipitación registradas están: En la zona de Contacto entre la Llanura y el Subandino y al Norte del departamento.
Según los mapas de isoyetas, isotermas e isolíneas de evapotranspiración real del Balance Hídrico Superficial de Bolivia (Roche et al., 1992) las características climáticas anuales de las provincias fisiográficas son las siguientes:
· En el Subandino, precipitaciones de 1,500 a 2,000 mm, temperaturas de 20 a 22ºC y evapotranspiración real entre 1,000 y 1,200 mm.
· En la Llanura Amazónica, precipitaciones de 1,600 a 2,000 mm, temperaturas de 24 a 26ºC y evapotranspiración real entre 1,200 y 1,400 mm.
· En el Ondulado Amazónico, precipitaciones de 1,700 a 1,900 mm, temperaturas de 25 a 27ºC y evapotranspiración real entre 1,400 y 1,500 mm.
· En el Escudo Precámbrico, precipitaciones de 1,500 a 1,700 mm, temperaturas de 24 a 26ºC y evapotranspiración real entre 1,200 y 1,300 mm.